植物保護是以預防為主，綜合處理的過程，而生物防治是現階段農業生產中防治病蟲害的主要手段。內生真菌在植保上的應用，能增強作物抗逆性、促進作物生長和防治病蟲害，滿足防治效果好、環境影響低、成本較低和節省農藥的要求。

內生真菌可分泌植物生長激素類物質，如吲哚乙酸、吲哚乙腈等，能明顯增加作物的株高、干重，提高果實和根莖的重量以及增強作物長勢等。袁志林等發現大戟科植物內生真菌B3能合成植物激素A和ABA，促進水稻的生長。易婷等對一株向日葵根瘤菌研究時發現，其能夠分泌胞外多糖來改變周圍土壤結構，達到促進植物的生長的作用。

植物內生真菌對作物致病菌的抑制作用

相對產殺蟲活性物質的內生真菌而言，對殺菌活性內生真菌的研究要多得多。主要分為從藥用植物中分離篩選拮抗內生真菌和從農作物中分離篩選活性內生真菌。王萬能等對從煙草中篩選得到的1株內生細菌進行研究發現，對小麥紋枯病病菌、棉花立枯病病菌、煙草灰霉病病菌、煙草炭疽病病菌、棉花枯萎病病菌和煙草疫霉菌等有抑制作用。

眾所周知，樺褐孔菌，是一種生長于白樺樹上的藥用真菌。

主要生長在北半球北緯40°~50°的地區，即俄羅斯西伯利亞、遠東地區、北歐、日本北海道、朝鮮、中國北部的黑龍江、吉林長白山等處。

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